در جلسه فوق‌العاده مجمع روحانيون مبارز، به اتفاق اكثريت آراء، خاتمي به رياست شوراي مركزي مجمع روحانيون مبارز برگزيده شد. محمدعلي ابطحي با اعلام اين خبر گفت: در فرصت‌هاي آينده با بازنگري در تشكيلات مجمع، دبيركل زير نظر رئيس شوراي مركزي انتخاب و مسوليت‌هاي اجرايي اين تشكل سياسي را برعهده خواهد گرفت.
وي همچنین با يادآوري این که جلسه فوق‌العاده مجمع از 3 روز گذشته با حضور اكثريت اعضا جز مهدي كروبي در منزل خاتمي برگزار شد، افزود: در اين جلسه ضمن تاكيد بر ضرورت تداوم كار مجمع در شرايط فعلي و فعال‌شدن اين تشكل روحاني در حوزه فكري و فرهنگي براي مبارزه همه‌جانبه و مقابله فعال و علمي با انديشه‌هاي الحادي، تفكرات متحجر و واپس‌گرايي كه بنام اسلام در جامعه فكري و سياسي وجود دارد و مقابله با طرز تفكر اباحه‌گري به عنوان رسالت اصلي مجمع روحانيون مبارز مورد تاكيد قرار گرفت.